Fondamentalmente gli aggiornamenti possono essere suddivisi nelle seguenti caategorie:

1. aggiornamenti delle individuazioni e plugin: di solito tali aggiornamenti sono pre-selezionati quando si utilizza l'apposita utilità; è fortemente consigliato scaricarli ogni volta che risultino disponibili, poichè sono responsabili dell'affidabilità delle individuazioni. Solitamente vengono denominati Detection rules, Advanced detection library, Detection support library o qualche plugin.
2. aggiornamenti in lingua locale: file di linguaggio e informazioni sui prodotti. Questi file non sono necessari se si utilizza Spybot-S&D esclusivamente in lingua inglese. Se si utilizza solo un'altra lingua sono necessari soltanto i file relativi.
3. aggiornamenti beta: se si è disposti ad aiutarci a migliorare Spybot-S&D, si potrebbe voler scaricare anche questi. Ricordare sempre la liberatoria per il beta test: potrebbero esserci molte nuove funzionalità, ma esiste anche il rischio di nuovi bug.
4. aggiornamenti della guida e documentazione sul malware: come già il nome indica, questi sono per chi desidera apprendere bene alcune informazioni, sul malware e su Spybot-S&D.
5. aggiornamenti completi: rari, ma quando viene rilasciata una nuova versione, di solito sono disponibili tramite lo strumento di aggiornamento.

Gli aggiornamenti al punto 2 e 3 non vengono visualizzati in maniera predefinita: nella versione 1.4 si possono attivare queste categorie dalla pagina delle Impostazioni, dalla versione 1.5 ci sono due caselle di controllo preposte nella pagina iniziale della nuova applicazione per gli aggiornamenti.